内蒙古医科大学设有基础医学院、药学院、中医学院、蒙医药学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院(自治区卫生政策研究所)、外国语学院、计算机信息学院、护理学院(卫生技术学校)、思想政治理论教研部、实践教学部、体育教学部、研究生学院、国际教育学院(对外合作与交流中心)、继续教育学院等16个教学单位，有3所直属附属医院、4所非直属附属医院，8所临床医学院。在区内外设有实践教学基地120个。其中，医学类专业实践教学基地50个、非医学类专业实践教学基地70个。
近年来，内蒙古医科大学承担各级各类科研项目1500余项。其中，国家自然科学基金项目153项，国家社科基金项目2项。学校参与研究的科研成果荣获国家科技进步二等奖1项，自治区科学技术奖76项(一等奖2项、中青年科技创新奖1项、二等奖31项、三等奖42项);自治区哲学社会科学优秀成果政府奖11项(二等奖2项、三等奖9项)。
内蒙古医科大学有自治区蒙医药协同创新培育中心、自治区肿瘤生物治疗协同创新培育中心2个自治区级协同创新中心;有自治区中蒙药重点实验室、自治区医学细胞生物学重点实验室、自治区分子病理学重点实验室、自治区分子生物学重点实验室、自治区分子影像学重点实验室5个自治区重点实验室;有新药筛选工程研究中心、动物脏器高值化利用生物活性肽工程实验室2个自治区工程研究中心(实验室。
内蒙古医科大学坐落于内蒙古自治区首府呼和浩特市，是一所以医学为主，集理学、管理学、工学、文学、法学于一体的多科性高等医药院校。学校成立于1956年，是新中国在少数民族地区最早建立的高等医学院校之一，当时隶属于国家卫生部，1958年划归内蒙古自治区管理。前身为内蒙古医学院，2012年3月，经教育部批准，更名为内蒙古医科大学。
内蒙古医科大学现有金山校区、新华校区、锡林校区三个教学园区，总占地面积1230141平方米，总建筑面积453591平方米。其中，教学行政用房面积203636平方米。教学科研仪器设备总值35343.22万元，各类图书文献105万册(种)。 内蒙古医科大学作为一所地方高等医药院校，肩负着为民族地区培养应用型医药卫生高级专门人才，开展医药科学研究，服务经济社会发展的崇高使命。
内蒙古医科大学现有专任教师926人。其中，教授220人，副教授211人，具有博士学位人员185人，硕士学位人员504人，专任教师中具有硕士及以上学位教师的比例为74.41%。有硕士生导师513人，兼职博士生导师14人。享受国务院政府特殊津贴专家63人，国家和自治区有突出贡献的中青年专家35人，国家“新世纪百千万人才工程”人选1人，自治区“新世纪321人才工程”第一、二层次人选72人次。
内蒙古医科大学一贯坚持开放办学的方针，重视与国内外高校的交流与合作。与北京大学、北京中医药大学、中国军事医学科学院、首都医科大学、天津中医药大学等高等院校建立了长期的合作关系;与日本、美国、英国、澳大利亚、俄罗斯、蒙古、白俄罗斯、匈牙利等国家和地区的多所医药院校或科研单位开展了多层次、多领域的学术交流与合作。学校现有全日制在校生14605人。其中，本科生10643人、专科生2325人、研究生1473人、留学生89人，民族预科生70人，中职生2173人，本科各专业面向国内28个省、市、自治区招生。
